يقول نائب ان الكتل السياسية الكبيرة تتجه نحو اقتسام المناصب في الهيئات المستقلة وفق مبدأ المحاصصة الفئوية والطائفية، من دون اعتماد مبدأ الكفاءة والخبرة لشغل المواقع القيادية في تلك الهيئات.
ويضيف النائب المستقل عن التحالف الوطني عبود العيساوي ان تشكيل عضوية الهيئات المستقلة وفقاً لترشيحات حزبية وسياسية، سيفقدها مفهومها وهويتها المستندة على مراقبة الاداء العام للدولة العراقية دون الخضوع للتأثيرات السياسية.
ويعتقد رئيس المجموعة العراقية للدراسات الاستراتيجية واثق الهاشمي ان الفترة المقبلة لن تشهد اي فرصة للمستقلين العراقيين للحصول على مقبولية الكتل السياسية لتولي ادارة الهيئات المستقلة، لافتاً الى ان قيادات الكتل السياسية تخوض الان مفاوضات صعبة للخروج بنتائج نهائية، لتقسيم المناصب المتبقية في الدولة العراقية ومنها الهيئات المستقلة.
ويشدد الخبير القانوني طارق حرب على ان الدستور والنظام الخاص بالهيئات المستقلة يرفض اي ترشيحات سياسية لقياداتها، باعتباره امراً يمس مبدأ الاستقلالية، الذي يعد نقطة جوهرية في تلك الهيئات.
وشهدت فترة رئيس الوزراء السابق نوري المالكي جدلاً دستورياً حول ارتباط الهيئات المستقلة بالسلطتين التنفيذية والتشريعية.